工程项目管理系统建设是一个复杂而重要的过程，需要考虑多个因素以确保系统的有效性和实用性。以下是一些关键因素的详细分析：

1. 项目需求与系统功能的匹配度

深入分析项目需求：包括项目的规模、复杂度、涉及的资源种类、所需遵循的标准和流程等。管理者应明确系统需要支持哪些具体功能，如项目计划、人员分配、任务管理、进度控制、成本预算、质量控制、风险管理等。

评估系统功能：选择的项目管理系统（EPS）应能够全面覆盖项目的全周期管理，并提供灵活的功能设置以适应项目的不同需求。系统还应支持多阶段管理，如策划与启动、执行与控制、以及收尾等。

2. 系统的灵活性与可扩展性

模块化配置：系统应支持模块化配置，能够根据项目的变化轻松调整功能设置，以适应不同项目的需求。

可扩展性：随着企业的发展和项目的增多，系统应能够进行相应的扩展和升级，以满足未来的需求。

集成性：系统应支持与其他企业软件系统的集成，如财务软件、人力资源管理系统等，以实现数据共享和业务流程的无缝对接。

3. 用户界面和易用性

直观性：一个直观、易上手的用户界面对于确保系统被频繁使用至关重要。系统应提供清晰的导航和操作指引，使用户能够快速上手。

易用性：系统应简化操作流程，减少用户的学习成本。同时，系统应提供便捷的帮助和支持功能，以便用户在使用过程中遇到问题时能够及时获得解答。

4. 成本与投资回报

全面评估成本：企业应全面评估获取和维护系统的总成本，包括软件购买费、定制费、培训费、维护费等。

预测收益：需要预测和量化系统带来的潜在收益，如提高工作效率、降低错误率、加强控制能力和提升决策质量等。通过评估投资回报率（ROI），确保所选系统能够在长期内为企业带来更大的价值。

5. 安全性与数据保护

数据加密：系统应具备强大的数据加密功能，确保项目数据在传输和存储过程中的安全性。

权限管理：系统应提供灵活的权限设置和角色定义功能，以适应项目组织架构并控制不同用户对数据的访问和操作权限。

数据备份与恢复：系统应支持定期的数据备份和恢复操作，以防意外情况导致的数据丢失或损坏。

6. 供应商的信誉与支持服务

选择可靠供应商：选择一个有良好口碑和强大支持团队的系统供应商至关重要。供应商应提供全面的培训、及时的技术支援和定期的软件更新。

客户案例与反馈：在选择之前，可以咨询供应商的客户案例，了解他们的服务记录和客户反馈，确保供应商能够提供可靠的长期合作和支持。以下为助流合作客户：

综上所述，工程项目管理系统建设需要考虑项目需求与系统功能的匹配度、系统的灵活性与可扩展性、用户界面和易用性、成本与投资回报、安全性与数据保护以及供应商的信誉与支持服务等多个因素。通过综合考虑这些因素，企业可以选择出最适合自身需求的工程项目管理系统，以提升项目管理效率并推动项目的成功实施。